Отраслевой стандарт 91500.09.0001-1999 «Протоколы ведения больных. Общие положения», утвержденный приказом Минздрава РФ от 3 августа 1999 г. № 303;
Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0001-2002 «Система стандартизации в здравоохранении Российской Федерации. Протокол ведения больных. Пролежни (L.89)», утвержденный приказом Минздрава РФ от 17 апреля 2002 г. № 123;
Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0002-2002 «Система стандартизации в здравоохранении Российской Федерации. Протокол ведения больных. Сердечная недостаточность (I50)», утвержденный приказом Минздрава РФ от 27 мая 2002 г. № 164;
Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0003-2003 Система стандартизации в здравоохранении Российской Федерации «Протокол ведения больных. Чесотка», утвержденный приказом Минздрава РФ от 24 апреля 2003 г. № 162;

Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0004-2003 «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника», утвержденный приказом Минздрава РФ от 9 июня 2003 г. № 231;
Отраслевой стандарт ОСТ 91500.11.0007-2003 Система стандартизации в здравоохранении Российской Федерации «Протокол ведения больных. Профилактика тромбоэмболии легочной артерии при хирургических и иных инвазивных вмешательствах», утвержденный приказом Минздрава РФ от 9 июня 2003 г. № 233;
Протокол ведения больных «Аллергический ринит», утвержденный Министерством здраво-охранения и социального развития РФ 28 апреля 2006 г.;
Протокол ведения больных «Болезнь Паркинсона (G20)», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 14 января 2005 г.;
Протокол ведения больных «Гемофилия», утвержденный Заместителем Министра здраво-охранения и социального развития РФ 30 декабря 2005 г.;
Протокол ведения больных «Гонококковая инфекция», утвержденный приказом Минздрава РФ от 20 августа 2003 г. № 415;
Протокол ведения больных «Железодефицитная анемия», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 22 октября 2004 г.;
Протокол ведения больных «Инсульт», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 10 февраля 2005 г.;
Протокол ведения больных «Кариес зубов», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 17 октября 2006 г.;
Протокол ведения больных «Лейомиома матки», утвержденный Министерством здраво-охранения и социального развития РФ 14 января 2005 г.;
Протокол ведения больных «Полное отсутствие зубов (полная вторичная адентия)», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 16 сентября 2004 г.;
Протокол ведения больных «Рассеянный склероз», утвержденный Министерством здраво-охранения и социального развития РФ 18 апреля 2005 г.;
Протокол ведения больных «Сифилис», утвержденный приказом Минздрава РФ от 25 июля 2003 г. № 327;
Протокол ведения больных «Судебно-психиатрическая экспертиза», утвержденный Мини-стерством здравоохранения и социального развития РФ 23 мая 2005 г.;
Протокол ведения больных «Урогенитальный трихомониаз», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 14 января 2005 г.;
Протокол ведения больных «Хроническая обструктивная болезнь легких», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 4 июля 2005 г.;
Протокол ведения больных «Частичное отсутствие зубов (частичная вторичная адентия)», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 16 сентября 2004 г.;
Протокол ведения больных «Эпилепсия», утвержденный Министерством здравоохранения и социального развития РФ 14 января 2005 г.;
Протоколы «Ведение детей, страдающих стоматологическими заболеваниями», утвержденный приказом Минздрава РФ от 30 декабря 2003 г. № 620;
Стандарты (модели протоколов) диагностики и лечения наркологических больных, утвержденные приказом Минздрава РФ от 28 апреля 1998 г. № 140;
Стандарты (протоколы) диагностики и лечения больных с неспецифическими заболеваниями легких (взрослое население), утвержденные приказом Минздрава РФ от 9 октября 1998 г. № 300.